Прокуратура Москвы 16 апреля 2021 года направила в Мосгорсуд иск с требованием признать экстремистскими организациями Фонд борьбы с коррупцией (ФБК), Фонд защиты прав граждан (ФЗПГ) и штабы Алексея Навального. 19 апреля Мосгорсуд засекретил материалы дела о запрете ФБК и штабов Навального из-за гостайны.
Штабы Навального в России временно прекратили свою работу. Это произошло после того, как прокурор Москвы Денис Попов приостановил деятельность «общественного движения „Штабы Навального“».
27 апреля Мосгорсуд удовлетворил ходатайство прокуратуры об ограничении деятельности ФБК и Фонда защиты прав граждан Алексея Навального.
29 апреля соратник Навального Леонид Волков заявил о роспуске региональных штабов. На следующий день стало известно, что Росфинмотиринг внес сеть штабов в «реестр экстремистов и террористов».
9 июня 2021 года Мосгорсуд признал Фонд борьбы с коррупцией, Фонд защиты прав граждан и штабы Алексея Навального экстремистскими организациями.